フリーランスも１年を超えたことですので、たまには昔を振り返りたいと思います。
項目別に比較をしてみることにしました。

昔：大手SIerでSE。９時〜１８時勤務。月平均残業40時間。土日祝休み。
今：フリーランスでアプリ開発。９〜１７時、２１時〜２３時。土日祝もたまに仕事。

自由度は大きく異なりますが、純粋に働いている時間で比較するとあまり変わっていないのはちょっと驚きでした。

普通に考えて拘束されるより、フリーの方が良いと思います。
ただ、休日なんかはフリーの場合曖昧ですので、いつ休んで良いのかわからないというような状況になることもありました。
休みの時も、休んでて良いのかという強迫観念にかられる時があります。

また子供の子守りなどで仕事したくてもできないということが何度かあり、確実に仕事の時間が確保されるのはいいなぁと感じたこともあります。
(会社勤めでも子守りの時は仕事できないんですがね。私の場合自宅で作業しているので、色々押し付けられたりということも・・・)

健康の面では昔も今もあまり変化はない気がします。

ただ食事に関して、昔は朝食はゆっくりとれず(ギリギリまで寝てる)、夕食の時間もバラバラでかなり遅くになることもあったので、規則正しくなりました。

ただ、会社勤めだと、1年に1回の健康診断があるのでもし何かの病気があれば早期発見につながると思います。

フリーだと自分で受けに行かなければならず、お金も必要ですのでその点は昔が良いですね。

ストレスという観点ではフリーランスの方がストレスは少ない気がします。
フリーランスというより、チーム等でなく完全に自分一人なのが大きいですね。

ただ、全くストレスがないかというとそういうわけではありません。
原因は様々ですが、いろいろなストレスの原因はあります。

・クライアントとのトラブル
なるべく避けたいところですが、発生してしまうこともあります。
・経済的な不安
経済面でも触れますが、会社勤めの時は全く心配していなかった経済的な不安というものがあります。
・将来の不安
不安定な職業ですから、10年後、5年後やっていけるのかという不安はあります。

フリーの場合、経済的な面でかなり不安定になります。この点は会社勤務が良いですね。
ただ、税金の面ではフリーでは節税できる箇所もあるので、多少のメリットもあります。

やった分だけ収入は増えるので、そういうのが楽しい人は良いですが、安定した生活という意味では会社勤めが良いですね。

私が元々がSIerにいたからかもしれませんが、技術的なスキルはフリーになってからの方が上がった気がします。

SEやってた時は、顧客や社内の調整が多く、Excelを見ることの方が多かったです。

コードを書くのはほとんど協力会社の方に依頼するので、コードも読めないまま仕様書だけ作るというなかなか嫌な状況でした。
(実装できない人が作るとイメージがないので、実際にコードに落とし込むときにかなり質問が来て回答にも詰まることが多々ありました。)

フリーになってからは最初から最後まで全部一人でやるので、スキルアップには良いです。

こちらもフリーになってからの方が感じますね。
会社勤めの場合、歯車の一部という感じが強く、なかなかやりがいを感じることはなかったです。

やりがいに関しては本当に人それぞれなので、自分がやりがいを見出せるところで働くということが正解だと思います。

私はフリーになって一番やりがいを感じたのが、お金の話になりますが、やった分だけ収入に直結することです。
会社勤めの場合、やったとしても給与に反映されるのはかなり遠回りで、なかなか実感はなかったですね。

その分、働けなくなった場合はすぐに収入が0になるので、危険な部分でもあります。

現時点ではフリーの方が私は向いてる気がします。
ただ、この先数年同じようにやっていける保証はないので、もしかしたらまた会社勤めに戻る可能性もあります。

目指すところは自分のプロダクトで食っていけるようになる、ですが、先は長そうです。